মোবাইল অপারেটিং সিস্টেমেরগুলোর মধ্যে অ্যাপলের আইওএসকেই সবচেয়ে নিরাপদ বলে রায় দিয়েছেন প্রযুক্তি-বিশ্লেষকেরা।
মোবাইল অপারেটিং সিস্টেমের ক্ষেত্রে সবচেয়ে বড় হুমকি মনে করা হয় স্পাইওয়্যারকে। সাম্প্রতিক এক পরীক্ষায় দেখা গেছে— স্পাইওয়্যারের কবলে আইওএস ছাড়া আর কোনো মোবাইল ওএস প্রতিরোধ গড়তে পারে না।

সম্প্রতি প্রযুক্তিবিষয়ক ওয়েবসাইট সিনেটের এক প্রতিবেদনে বলা হয়েছে, আইনশৃঙ্খলা রক্ষাকারী বাহিনী ও গোয়েন্দা সংস্থার সাহায্যার্থে  ফিনস্পাই নামে একটি স্প্যাইওয়্যার দিয়ে মোবাইল অপারেটিং সিস্টেমগুলো নিয়ে গোপন গবেষণা চালানো হয়। দূর থেকে মোবাইল ফোন ও ট্যাবলেট কম্পিউটারে নজরদারি করার ক্ষেত্রে তা কতখানি নিরাপদ ও ব্যবহারকারীর ফোন কল, কন্ট্যাক্ট বা অন্যান্য তথ্যের কতটা নিরাপত্তা দিতে পারে সে লক্ষে এই স্পাইওয়্যার  দিয়ে পরীক্ষা চালিয়েছে গামগ্রুপ নামের একটি প্রতিষ্ঠান। পরীক্ষায় দেখা গেছে, শক্তিশালী স্পাইওয়্যার অ্যাপলের আইওএস অপারেটিং সিস্টেম বাদে সব ধরনের অপারেটিং সিস্টেমের নিরাপত্তা বলয় ভেঙে ফেলতে সক্ষম। অ্যান্ড্রয়েড, ব্ল্যাকবেরি, সিমবিয়ান কিংবা উইন্ডোজের তুলনায় আইওএস প্ল্যাটফর্ম বেশি নিরাপদ। তবে দেখা গেছে, জেলব্রোকেন মোডে আইওএস স্পাইওয়্যার ঠেকাতে পারে না।